「健康存摺」系統為一線上健康資料查詢系統，提供健保保險對象可隨時隨地便利地查詢個人的健康資料，掌握健康大小事、做好自我健康管理！也可以在就醫時，提供醫師參考，幫助醫師快速掌握個人健康狀況，提升醫療照護安全與品質。
「健康存摺」系統於103年9月25日在健保署官網上線，只要持自然人憑證或已註冊密碼之健保卡，通過身分驗證，即可於「健康存摺」網頁查詢或下載個人的健康資料。或使用智慧型手機下載全民健保快易通APP，點選健康存摺輸入帳號密碼，就可以透過手機查閱個人健康存摺資料。
自105年7月起，為提升服務效能，「健康存摺」系統進行全面改版，包括：資料視覺化呈現、增加外部衛教連結、擴大資料提供範圍，以及提升「健康存摺」取得可近性及使用便利性等功能，希望能讓「健康存摺」為民眾發揮最佳功能。
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